NAME Plataforma de Biología Computacional

DESCRIPTION

Provee una visión global del análisis de datos siguiendo las buenas prácticas de investigación, desde el diseño experimental, análisis de datos, análisis estadístico, visualización, preparación de publicaciones de investigación, respuestas a los revisores y el depósito de los datos ómicos en bases de datos públicas. La Plataforma cuenta con más de 90 publicaciones en revistas de alto impacto como Science (Moore et al, 2015), Naturaleza (Knobloch et al, 2013; Ko et al, 2010; Kim et al, 2009; Kim et al, 2008), Nature Cell Biology (Ohnishi et al, 2014; Esch et al, 2013; Han et al, 2011), Cell (Han et al, 2010; Singhal et al, 2010; Kim et al, 2009), Cell Stem Cell (Rao et al, 2016; Song et al, 2016; Kubaczka et al, 2015; Han et al, 2012; Ko et al, 2009).

FIELDS OF APPLICATION

Digital health

Electromedical devices

In-Vitro diagnostics

Medical Image

SERVICES OFFERED BY THE ASSET

Image Analysis

AI algorithms development

Massive sequencing studies data analysis

-Complete genome analysis -cDNA based transcriptome, smallRNA análisis (RNA-seq) -ChIP-Sec DNA fragment isolation sequencing Isolated DNA gragments sequencing. -Superenhancers discovery. -DNA Methylation sequencing (Meth-Sec) -Variant calling.

Micro-array data analysis

Affymetrix, Agilent, Illumina, Roche NimbleGen, among others, Microarray analysis, including: Gene expression; microRNAs expression; DNA Methylation; Copy Number Analysis (CNA)

ENTITY MANAGING THE ASSET

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Biodonostia Health Research Institute
Contact person:
IIS Biodonostia
amaia.delvillar@biodonostia.org