NAME Plataforma de Genómica
La Plataforma de Genónica (PG) implementa técnicas de genómica y transcriptómica mediante el uso de equipos de última generación para secuenciar, genotipar y analizar la expresión génica y desarrollo final del sistema de PCR en tiempo real QuantStudio 12K Flex antes de su lanzamiento al mercado. Se analizan varios perfiles de huellas dactilares de miARN y ADN utilizando el instrumento de PCR en tiempo real y se proporcionaron paneles OpenArray. Nuestro trabajo permitió a la empresa optimizar el software rendimiento y usabilidad, así como el flujo de trabajo del usuario para la carga y el manejo de OpenArray. De manera similar, el equipo FALCON de Life Technologies es un Grupo con sede en Europa que tiene experiencia a largo plazo con colaboraciones de clientes líderes a nivel mundial para el desarrollo de productos o flujos de trabajo. Nuestra participación en el consorcio FALCON-BRCA coordinado por Life Technologies nos permitió implementar uno de los conjuntos de genes más prevalentes (BRCA1 y 2) en el cáncer de mama, así como interactuar con otros servicios de NGS. Desde marzo de 2014, nuestro laboratorio es un sitio de referencia autorizado para la tecnología Ion Torrent y gestiona sus procesos siguiendo las directrices de la Norma UNE-EN ISO 9001:2015 estando su Sistema de Gestión de la Calidad certificado por AENOR.
FIELDS OF APPLICATION
Biomedical consumables
In-Vitro diagnostics
Laboratory equipment
MOST OUTSTANDING EQUIPMENT AND COMPONENTS
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7900HT real time PCR system
7900HT real time PCR system
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ABI3130xl sequencer
ABI3130xl sequencer
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Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)
Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)
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GeneChip Affymetrix genetic analysis system
GeneChip Affymetrix genetic analysis system
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PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing
PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing
SERVICES OFFERED BY THE ASSET
Bidimensional gels scanning-DIGE
Bidimensional gels scanning-DIGE
DNA and RNA Quality analysis and quantification
DNA and RNA Quality analysis and quantification
Human cell lines authentication
Identification and authentication of human cell lines and intra-species cross contamination with detection with GenePrint® 10 System de Promega
MAGPIX (Luminex)
Protein and nucleic acid qualitative and quantitative analysis
Massive sequencing (PGM – Ion Torrent)
Complete sequencing of reduced and viral genomes, mitochondrial sequencing, sequencing and quantification of microRNAs, sequencing of kits on demand with genes of interest
Microarray expression analysis
GeneChip Affymetrix Platform
PCR digital (Droplet Digital polymerase chain reaction – ddPCR)
Absolute quantification without a standard curve, genomic alterations such as copy number variation (CNV), rare sequences, gene expression and microRNA analysis, massive sequencing -NGS- (quantification of libraries; validation of results) and single cell analysis.
Real time qPCR
With specific primers to determine number of copies or relative quantity of a specific DNA or RNA sequence.
Sanger sequencing services
Sanger sequencing services (1100-1300 pb fragments), Fragment analysis
ENTITY MANAGING THE ASSET
Contact person:
IIS Biodonostia
amaia.delvillar@biodonostia.org