DENOMINACIÓN Plataforma de Genómica

DESCRIPCIÓN

La Plataforma de Genónica (PG) implementa técnicas de genómica y transcriptómica mediante el uso de equipos de última generación para secuenciar, genotipar y analizar la expresión génica y desarrollo final del sistema de PCR en tiempo real QuantStudio 12K Flex antes de su lanzamiento al mercado. Se analizan varios perfiles de huellas dactilares de miARN y ADN utilizando el instrumento de PCR en tiempo real y se proporcionaron paneles OpenArray. Nuestro trabajo permitió a la empresa optimizar el software rendimiento y usabilidad, así como el flujo de trabajo del usuario para la carga y el manejo de OpenArray. De manera similar, el equipo FALCON de Life Technologies es un Grupo con sede en Europa que tiene experiencia a largo plazo con colaboraciones de clientes líderes a nivel mundial para el desarrollo de productos o flujos de trabajo. Nuestra participación en el consorcio FALCON-BRCA coordinado por Life Technologies nos permitió implementar uno de los conjuntos de genes más prevalentes (BRCA1 y 2) en el cáncer de mama, así como interactuar con otros servicios de NGS. Desde marzo de 2014, nuestro laboratorio es un sitio de referencia autorizado para la tecnología Ion Torrent y gestiona sus procesos siguiendo las directrices de la Norma UNE-EN ISO 9001:2015 estando su Sistema de Gestión de la Calidad certificado por AENOR.

ÁMBITOS DE APLICACIÓN

Consumibles biomédicos

Consumibles biomédicos

Diagnóstico in vitro

Equipamiento de laboratorio

Diagnóstico in vitro

Equipamiento de laboratorio

EQUIPOS Y COMPONENTES MÁS DESTACADOS

  • Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

    Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

  • ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

    ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

  • ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

    ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

  • Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

    Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

  • Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

    Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

  • Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

    Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

  • PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

    PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

  • PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

    PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

  • Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

    Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

  • Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

    Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

SERVICIOS OFRECIDOS POR EL ACTIVO

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Autentificación de líneas celulares humanas

El Sistema GenePrint® 10 System de Promega permite la identificación y autentificación de líneas celulares humanas así como la detección de contaminación intraespecie.

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Estudio de Microarrays de expresión

Plataforma GeneChip Affymetrix.

Autentificación de líneas celulares humanas

El Sistema GenePrint® 10 System de Promega permite la identificación y autentificación de líneas celulares humanas así como la detección de contaminación intraespecie.

Lector Multiple MAGPIX (Luminex)

Análisis cualitativos y cuantitativos de proteínas y ácidos nucleicos

Lector Multiple MAGPIX (Luminex)

Análisis cualitativos y cuantitativos de proteínas y ácidos nucleicos

Secuenciación masiva (PGM – Ion Torrent)

Secuenciación completa de genomas reducidos y virales, secuenciación mitocondrial, secuenciación y cuantificación de microRNAs, secuenciación de kits a la carta con genes de interés

Estudio de Microarrays de expresión

Plataforma GeneChip Affymetrix.

PCR a tiempo real o PCR cuantitativa

Utilizando cebadores específicos de secuencia es posible determinar el número de copias o la cantidad relativa de una determinada secuencia de ADN o ARN.

PCR digital (Droplet Digital polymerase chain reaction – ddPCR)

Cuantificación absoluta sin curva patrón, alteraciones genómicas como la variación del número de copias del gen (copy number variation – CNV), secuencias raras, expresión de genes y análisis de microARN, secuenciación masiva –NGS- (cuantificación de librerías; validación de resultados) y análisis de célula única.

PCR digital (Droplet Digital polymerase chain reaction – ddPCR)

Cuantificación absoluta sin curva patrón, alteraciones genómicas como la variación del número de copias del gen (copy number variation – CNV), secuencias raras, expresión de genes y análisis de microARN, secuenciación masiva –NGS- (cuantificación de librerías; validación de resultados) y análisis de célula única.

PCR a tiempo real o PCR cuantitativa

Utilizando cebadores específicos de secuencia es posible determinar el número de copias o la cantidad relativa de una determinada secuencia de ADN o ARN.

Secuenciación de Sanger Simple

Secuenciación de Sanger Simple, Secuenciación de Sanger Larga (Fragmentos entre 1100-1300 pb), Análisis de Fragmentos

Secuenciación de Sanger Simple

Secuenciación de Sanger Simple, Secuenciación de Sanger Larga (Fragmentos entre 1100-1300 pb), Análisis de Fragmentos

Secuenciación masiva (PGM – Ion Torrent)

Secuenciación completa de genomas reducidos y virales, secuenciación mitocondrial, secuenciación y cuantificación de microRNAs, secuenciación de kits a la carta con genes de interés

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO
Biodonostia Health Research Institute
Persona de contacto:
IIS Biodonostia
amaia.delvillar@biodonostia.org