DENOMINACIÓN Plataforma de Genómica

DESCRIPCIÓN

La Plataforma de Genónica (PG) implementa técnicas de genómica y transcriptómica mediante el uso de equipos de última generación para secuenciar, genotipar y analizar la expresión génica y desarrollo final del sistema de PCR en tiempo real QuantStudio 12K Flex antes de su lanzamiento al mercado. Se analizan varios perfiles de huellas dactilares de miARN y ADN utilizando el instrumento de PCR en tiempo real y se proporcionaron paneles OpenArray. Nuestro trabajo permitió a la empresa optimizar el software rendimiento y usabilidad, así como el flujo de trabajo del usuario para la carga y el manejo de OpenArray. De manera similar, el equipo FALCON de Life Technologies es un Grupo con sede en Europa que tiene experiencia a largo plazo con colaboraciones de clientes líderes a nivel mundial para el desarrollo de productos o flujos de trabajo. Nuestra participación en el consorcio FALCON-BRCA coordinado por Life Technologies nos permitió implementar uno de los conjuntos de genes más prevalentes (BRCA1 y 2) en el cáncer de mama, así como interactuar con otros servicios de NGS. Desde marzo de 2014, nuestro laboratorio es un sitio de referencia autorizado para la tecnología Ion Torrent y gestiona sus procesos siguiendo las directrices de la Norma UNE-EN ISO 9001:2015 estando su Sistema de Gestión de la Calidad certificado por AENOR.

ÁMBITOS DE APLICACIÓN

Consumibles biomédicos

Diagnóstico in vitro

Equipamiento de laboratorio

EQUIPOS Y COMPONENTES MÁS DESTACADOS

  • ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

    ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

  • Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

    Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

  • PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

    PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

  • Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

    Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

  • Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

    Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

SERVICIOS OFRECIDOS POR EL ACTIVO

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Autentificación de líneas celulares humanas

El Sistema GenePrint® 10 System de Promega permite la identificación y autentificación de líneas celulares humanas así como la detección de contaminación intraespecie.

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Estudio de Microarrays de expresión

Plataforma GeneChip Affymetrix.

Lector Multiple MAGPIX (Luminex)

Análisis cualitativos y cuantitativos de proteínas y ácidos nucleicos

PCR a tiempo real o PCR cuantitativa

Utilizando cebadores específicos de secuencia es posible determinar el número de copias o la cantidad relativa de una determinada secuencia de ADN o ARN.

PCR digital (Droplet Digital polymerase chain reaction – ddPCR)

Cuantificación absoluta sin curva patrón, alteraciones genómicas como la variación del número de copias del gen (copy number variation – CNV), secuencias raras, expresión de genes y análisis de microARN, secuenciación masiva –NGS- (cuantificación de librerías; validación de resultados) y análisis de célula única.

Secuenciación de Sanger Simple

Secuenciación de Sanger Simple, Secuenciación de Sanger Larga (Fragmentos entre 1100-1300 pb), Análisis de Fragmentos

Secuenciación masiva (PGM – Ion Torrent)

Secuenciación completa de genomas reducidos y virales, secuenciación mitocondrial, secuenciación y cuantificación de microRNAs, secuenciación de kits a la carta con genes de interés

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO
Biodonostia Health Research Institute
Persona de contacto:
IIS Biodonostia
amaia.delvillar@biodonostia.org