DENOMINACIÓN Genomics platform

DESCRIPCIÓN

The Genomics Platform offers advice for, and interaction with, research groups to help them implement the most appropriate genomic and transcriptomic techniques for the biological problems being studied and to help them design and/or refine new experimental approaches. For that purpose, the platform has a qualified staff, the latest techniques and equipment for sequencing, genotyping and analyzing gene expression and a lab which was designed following recommendations based on good laboratory practices.

ÁMBITOS DE APLICACIÓN

Consumibles biomédicos

Diagnóstico in vitro

Equipamiento de laboratorio

EQUIPOS Y COMPONENTES MÁS DESTACADOS

  • ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

    ABI3130xl (secuenciador de 16 capilares)

  • Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

    Bio-Rad Droplet Digital PCR (ddPCR)

  • PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

    PGM Ion Torrent - Next Generation Sequencing

  • Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

    Sistema de análisis genético GeneChip Affymetrix

  • Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

    Sistema de PCR en tiempo real rápido 7900HT

SERVICIOS OFRECIDOS POR EL ACTIVO

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Análisis de calidad y cuantificación de ARN y ADN

Autentificación de líneas celulares humanas

El Sistema GenePrint® 10 System de Promega permite la identificación y autentificación de líneas celulares humanas así como la detección de contaminación intraespecie.

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Escaneado de geles bidimensionales-DIGE

Estudio de Microarrays de expresión

Plataforma GeneChip Affymetrix.

Lector Multiple MAGPIX (Luminex)

Análisis cualitativos y cuantitativos de proteínas y ácidos nucleicos

PCR a tiempo real o PCR cuantitativa

Utilizando cebadores específicos de secuencia es posible determinar el número de copias o la cantidad relativa de una determinada secuencia de ADN o ARN.

PCR digital (Droplet Digital polymerase chain reaction – ddPCR)

Cuantificación absoluta sin curva patrón, alteraciones genómicas como la variación del número de copias del gen (copy number variation – CNV), secuencias raras, expresión de genes y análisis de microARN, secuenciación masiva –NGS- (cuantificación de librerías; validación de resultados) y análisis de célula única.

Secuenciación de Sanger Simple

Secuenciación de Sanger Simple, Secuenciación de Sanger Larga (Fragmentos entre 1100-1300 pb), Análisis de Fragmentos

Secuenciación masiva (PGM – Ion Torrent)

Secuenciación completa de genomas reducidos y virales, secuenciación mitocondrial, secuenciación y cuantificación de microRNAs, secuenciación de kits a la carta con genes de interés

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO

ENTIDAD QUE GESTIONA EL ACTIVO
Biodonostia Health Research Institute
Persona de contacto:
IIS Biodonostia
amaia.delvillar@biodonostia.org